企业如何确认投资收益？
首先要搞清楚，公司法规定的是法定盈余公积金和任意盈余公积金的提取，没有规定必须转增股本. 所以从法律上来讲，可以全额提取，也可以用来弥补亏损。 但是从实际操作来看，一般只能提取部分用于投资者分红，因为如果全部提取可能造成的后果就是公司的注册资本严重不足(比如说注册一个10万的公司，每年把利润都分配掉了，那到第二年很可能连10万本金都没有了).这种情况是法律不允许的。
至于你说用税后利润转增资本金的问题，在现行制度下，只有股份有限公司才可以进行这样的操作，而且还要经过有关审计机构审核，过程比较复杂。 如果你说的这个企业是个有限责任公司而不是股份有限公司，那么根本不存在这个问题，因为有限公司的股东以其出资额为限对公司承担责任，只要股东不抽逃资金，就不存在注册资本不足的问题；即使以后经营不善，债务远远超过股东的出资数额，也没有关系，超出部分由公司的资产来承担。
所以有限公司的经营收益除了依法纳税外完全归股东所有，除非股东同意将其投入公司作为增资，否则就只能以现金方式返还给股东。 对于你提到的“投资所得”问题，我估计你的意思是指从被投资公司那里分得的利润？如果是的话，则被投资企业的生产经营所得和其他所得都要缴25%的企业所得税，另外股东从被投资企业取得利息、股息、红利等收入也要征收20%的个人所得税(从2008年10月9日起，证券交易印花税改为单边征税)，也就是说最后能够拿到手上的可能已经没有了75%，非常少。